校旗

一、大陸時期（北平輔仁）

校旗上的符號是輔仁大學英文名Catholic University的縮寫。

二、臺灣時期（臺北輔仁）

校旗由本校神長們共同制訂，黃白相間的顏色和教廷旗顏色相同，英文校名中的Catholic代表本校直屬羅馬教廷，中間12顆星，象徵本校主保──聖母。